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使用PAML进行火火爆网页游戏爆网页游戏私服时间计算

时间:2020-06-23 01:22 | 来源:gdsc.net.cn | 编辑:网页游戏私服排行榜

小编导读:老师,您好!关于使用approximate likelihood方法估计分化时间,我有以下几个问题想咨询: (1)在计算g和H时候,这一步中model是如何选择的?manual好像说model=0或者1时,计算的有些不符合实际。而建议model=2

老师,,您好!关于使用approximate likelihood方法估计分化时间,我有以下几个问题想咨询:
请您给予解答,谢谢。

(2)估计分化时间中,usedata=2中,控制文件rgene_gamma和sigma2_gamma是如何设置的? manual中提出这两个参数不可以用默认参数,我在manual中明白了rgene_gamma的设置方法是根据计算的碱基替换率来设置,但是没有明白sigma2_gamma是如何设置的。
(1)在计算g和H时候,这一步中model是如何选择的?manual好像说model=0或者1时,计算的有些不符合实际。而建议model=2时,需要提供aaRatefile,而aaRatefile有很多种,这个是如何选择的? 计算出来的g和H如何评价呢?

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